Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BlmO88700 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BlmO88700 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BlmO88700 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BlmO88700 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
BlmO88700 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BlmO88700 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BlmO88700 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BlmO88700 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BlmO88700 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BlmO88700 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BlmO88700 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BlmO88700 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BlmO88700 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BlmO88700 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BlmO88700 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BlmO88700 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BlmO88700 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BlmO88700 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BlmO88700 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BlmO88700 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BlmO88700 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BlmO88700 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BlmO88700 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BlmO88700 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BlmO88700 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BlmO88700 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BlmO88700 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BlmO88700 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BlmO88700 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BlmO88700 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BlmO88700 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BlmO88700 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BlmO88700 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BlmO88700 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BlmO88700 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BlmO88700 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BlmO88700 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BlmO88700 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BlmO88700 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BlmO88700 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BlmO88700 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BlmO88700 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BlmO88700 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BlmO88700 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms