Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd83O88324 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd83O88324 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms