Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SfnO70456 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SfnO70456 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SfnO70456 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SfnO70456 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SfnO70456 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SfnO70456 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SfnO70456 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SfnO70456 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SfnO70456 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SfnO70456 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SfnO70456 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SfnO70456 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SfnO70456 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SfnO70456 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SfnO70456 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SfnO70456 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SfnO70456 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SfnO70456 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SfnO70456 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms