Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtssO70370 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtssO70370 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtssO70370 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtssO70370 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtssO70370 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtssO70370 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtssO70370 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtssO70370 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtssO70370 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtssO70370 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtssO70370 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtssO70370 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms