Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rad51dO55230 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rad51dO55230 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms