Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eif6O55135 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Eif6O55135 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Eif6O55135 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms