Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap2O55126 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nipsnap2O55126 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nipsnap2O55126 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms