Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrxO55103 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrxO55103 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrxO55103 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrxO55103 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PrxO55103 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrxO55103 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrxO55103 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PrxO55103 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrxO55103 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrxO55103 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrxO55103 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrxO55103 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrxO55103 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrxO55103 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrxO55103 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrxO55103 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrxO55103 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrxO55103 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PrxO55103 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrxO55103 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrxO55103 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrxO55103 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrxO55103 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PrxO55103 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrxO55103 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms