Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema6bO54951 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema6bO54951 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms