Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NlkO54949 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NlkO54949 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NlkO54949 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NlkO54949 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NlkO54949 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms