Protein–RNA interactions for Protein: O54926

Siva1, Apoptosis regulatory protein Siva, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siva1O54926 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siva1O54926 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siva1O54926 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Siva1O54926 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siva1O54926 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siva1O54926 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siva1O54926 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siva1O54926 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Siva1O54926 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Siva1O54926 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Siva1O54926 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Siva1O54926 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siva1O54926 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siva1O54926 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siva1O54926 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siva1O54926 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siva1O54926 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Siva1O54926 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Siva1O54926 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms