Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjd2O54851 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjd2O54851 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms