Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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CrxO54751 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CrxO54751 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CrxO54751 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrxO54751 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrxO54751 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrxO54751 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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