Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccr6O54689 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms