Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk5r2O35926 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk5r2O35926 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms