Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1mwO35599 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Opn1mwO35599 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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