Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pkd2O35245 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pkd2O35245 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pkd2O35245 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms