Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn9O35239 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn9O35239 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms