Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Nedd9O35177 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nedd9O35177 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nedd9O35177 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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