Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Kcns1O35173 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Kcns1O35173 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcns1O35173 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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