Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr1aO35134 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr1aO35134 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr1aO35134 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms