Protein–RNA interactions for Protein: O08992

Sdcbp, Syntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdcbpO08992 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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SdcbpO08992 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SdcbpO08992 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SdcbpO08992 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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