Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sema3aO08665 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3aO08665 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3aO08665 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3aO08665 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3aO08665 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sema3aO08665 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema3aO08665 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema3aO08665 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms