Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec22bO08547 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sec22bO08547 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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