Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20878L7N244 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20878L7N244 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms