Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21310J3QQ23 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm21310J3QQ23 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21310J3QQ23 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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