Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm39307-201ENSMUST00000216780 1037 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm16551-203ENSMUST00000160979 3162 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Gm21887J3QQ04 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms