Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm5849J3QPE5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5849J3QPE5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms