Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm8356J3QPD3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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