Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2035J3QP87 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2035J3QP87 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms