Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm17577J3QNF7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm17577J3QNF7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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