Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gm21972J3QN38 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21972J3QN38 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21972J3QN38 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm21972J3QN38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm21972J3QN38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Gm21972J3QN38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21972J3QN38 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Gm21972J3QN38 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21972J3QN38 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21972J3QN38 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21972J3QN38 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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