Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm20918J3QN17 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm20918J3QN17 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm20918J3QN17 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm20918J3QN17 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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