Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Zfp616J3QN14 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Zfp616J3QN14 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp616J3QN14 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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