Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21244J3QK38 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21244J3QK38 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms