Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn34c3J3QJW5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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