Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm21411J3KMS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm21411J3KMS0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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