Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AK157302I3ITR1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AK157302I3ITR1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms