Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pabpc4lG5E8X2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc4lG5E8X2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms