Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cldn20G5E8X0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn20G5E8X0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn20G5E8X0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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