Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rnf148G3X9R7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf148G3X9R7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms