Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
5830473C10RikF8VQ07 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms