Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Ercc6F8VPZ5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ercc6F8VPZ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Ercc6F8VPZ5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms