Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm28048F7BCN0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28048F7BCN0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms