Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Gm20538F6Z9R1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms