Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Crocc2F6XLV1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Crocc2F6XLV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Crocc2F6XLV1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms