Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pagr1bF6V0H0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pagr1bF6V0H0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms