Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prss56F2YMG0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prss56F2YMG0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms