Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pdzd7E9Q9W7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdzd7E9Q9W7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms