Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp17lbE9Q9U0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp17lbE9Q9U0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms